No Brasil, atua desde 1990 com o objetivo de fortalecer as idéias democráticas, apoiar os movimentos sociais e contribuir para o desenvolvimento político, social e ambiental em bases sustentáveis.

Em 2000, a Fundação inaugurou escritório próprio no Rio de Janeiro que, desde 2004, é responsável também por programas em todo o Cone Sul (países do Mercosul e
Chile). Além disso, o escritório brasileiro trabalha em estreita cooperação com a sede em Berlim e com o escritório regional para México, Centro América e Caribe.

Projetos e programas:
A Fundação Heinrich Böll trabalha em parceria com organizações não-governamentais, movimentos sociais, universidades, sindicatos e outros atores.
Através de seminários e workshops de capacitação, a instituição contribui para a formação e qualificação de lideranças, e apóia programas e projetos específicos (ver parceiros), sempre relacionados a estratégias para uma mudança política, social e econômica em bases sustentáveis.

Programa Brasil: Democracia, sustentabilidade e direitos no Brasil:
A partir de 2006, a Fundação Heinrich Böll no Brasil passa a atuar com um programa único, “Democracia, Sustentabilidade e Direitos no Brasil".
O novo programa tem como objetivo geral contribuir para a promoção do estabelecimento de relações internacionais justas e o desenvolvimento sustentável com democracia de gênero, justiça social e garantia de direitos humanos.

Os componentes do novo programa e seus objetivos gerais são os seguintes:

Desenvolvimento sustentável: Fortalecer a capacidade da sociedade brasileira de influenciar as políticas públicas de desenvolvimento sustentável e de garantir o seu controle social.

Biopolítica – Processos de privatização e regulação da vida: Ampliar o envolvimento da sociedade na discussão sobre as implicações e conseqüências éticas, políticas, sociais e ambientais relacionadas à privatização e manipulação dos processos básicos da vida.

Globalização e processos de integração: Contribuir para a construção de processos de integração internacional numa perspectiva de desenvolvimento sustentável, de justiça e eqüidade entre os países.

Garantia de direitos humanos: Promover uma maior efetividade dos Direitos Humanos, Econômicos, Sociais, Culturais e Ambientais (DHESCA) no Brasil.

Onde:
A atuação da Fundação Heinrich Böll se dá em nível regional, nacional e internacional. Um objetivo prioritário é o fomento dos diálogos Norte-Sul e Sul-Sul, sempre objetivando valores como igualdade e promoção social, igualdade de gêneros e o respeito aos direitos humanos, além da defesa do meio ambiente.